并且又在明万历二年公元15年11月初9日，先后进攻广东承宣布政使司潮州府潮阳县踏头埠、饶平县柘林村、惠来县靖海备御千户所、惠州府陆丰县碣石卫，等广东承宣布政使司沿海港埠。
使得大明帝国被迫集中水陆主力，一起来围剿海盗，而海盗首领：林凤，则以潮州府南澳岛为根据地，与明军相持不下。
后因官府断绝一切沿海物资，让海盗们无粮可吃被迫修议和求抚，但明广东总兵：殷正茂，却不予接纳发誓要消灭叛军。
惹得海盗们为了避开官兵进剿，由海盗首领：林凤，率战舰62艘携带5500余人，南下转移到吕宋都督府（西班牙哈布斯堡王朝驻菲律宾都督府岛）并与先期占领了马尼拉皇家审问院的西班牙哈布斯堡王朝驻军展开了激战。
由于战场周围地势险恶，又加之风向不利，故而海盗首领只好率领船队退守背山临河，又可通向大海的邦阿西楠一地，但河口却被西班牙哈布斯堡王朝驻军封锁不久。
此刻追剿海盗们的大明潮州府大城备御千户所把总：王望高，率大军追至马尼拉皇家审问院，并与围困海盗的西班牙哈布斯堡王朝子爵兼菲律宾总督：吉多·德·拉维萨雷斯，商定；如果能够俘虏或杀死林凤，须将其人或尸体移交到大明朝廷。
另外明大城备御千户所把总则答应带西班牙哈布斯堡王朝子爵兼菲律宾总督，手下的使节奥古斯丁会修士：马丁·德拉达，和奥古斯丁会修士：赫罗尼莫·马林，以及两名大明通事：林必秀、陈辉然，和部分士兵一同前往福建承宣布政使司，以便进一步商议通商及宣教之事。
随后奥古斯丁会修士：马丁·德拉达，一行人在来到福建承宣布政使司后的两个月中，在两位大明通事：林必秀、陈辉然，的陪同下，拜见了大明福建承宣布政使司的各级地方官吏，并对大明帝国民间进行了实地观察。
同时还买下了上百种大明图，但就在这时，由于大明武将方面久久没有从菲律宾都督府传来有关海盗首领：林凤，的任何消息，故此福建承宣布政使司以及广东承宣布政使司两地官员们，就开始怀疑奥古斯丁会修士：马丁·德拉达，一行人来华的目地非凡？
于是就将他们遣送回菲律宾都督府岛，而事实上海盗首领：林凤，已率部下巧妙地突破了西班牙哈布斯堡王朝驻军的包围，并驶向辽阔的大海。
所以当奥古斯丁会修士：马丁·德拉达，一行人返回菲律宾都督府马尼拉皇家审问院时，已由西班牙哈布斯堡王朝拉古斯夫上校：弗朗西斯科·德桑德，继任菲律宾总督之职，他同样狂热地主张入侵中大明帝国。
而奥古斯丁会修士：马丁·德拉达，又带回了的有关大明拥有无尽财富的信息，这更加坚定了西班牙哈布斯堡王朝拉古斯夫上校兼菲律宾总督：弗朗西斯科·德桑德，征服大明的渴望。
尤其是奥古斯丁会修士：马丁·德拉达，从大明带回的各类图，经两名大明通事：林必秀、陈辉然，翻译成西班牙后，才使得菲律宾总督在制订入侵大明的计划时，有了更充分的依据。
于是菲律宾总督在明万历四年公元156年6月初日，给西班牙哈布斯堡王朝国王：菲利浦二世，的信中写到；他已得了大明的地图、航海图，以及记载大明国情的各类图资料。
其中他还特别指出“西班牙语；大明人不太好战，且不擅长使用武器（因为沿海多数都是备御千户所屯田军户，就算用也是火器，故此夷人不太了解），只要有200人一伙的海盗就能洗劫一座3万人的大城，如果王室能够集合1万2千人，再加上一部分安土桃山、菲律宾都督府、弗朗基王国，三路雇佣军，合计不超过2万5千人，就足以吞并大明，再配备一些长矛、火绳枪、船只、火炮，和其他军火器备，那么进攻大明会易如反掌。”
同时在论及此次远征对于西班牙哈布斯堡王朝国王的重要意义时，菲律宾总督还指出“西班牙语；大明人口众多，每年仅向皇帝缴纳的赋税即达3000万之巨额，难道远征大明之事不正是国王陛下应当大力促成，并使其完成于朝夕之间吗？”
按照领土面积估算，西班牙哈布斯堡王朝国土面积约为50万平方公里，只比四川承宣布政使司大一点，他们又哪里来的自信，敢制定出这种贪心不足蛇吞象般的荒诞计划？
其实西班牙哈布斯堡王朝人的自信，其实是源自于其军事实力，在大航海时代中，西班牙哈布斯堡王朝人就掌握了，当时最先进的火器和战船建造技术，而当时的世界大部分地区的军队，却仍然停留在刀枪弓箭为主的冷兵器时代，与西班牙哈布斯堡王朝军队的武器装备产生了巨大的代差。
在征服美洲之战中，西班牙哈布斯堡王朝曾经创下纪录，先后投入不足一千人的军队，就征服了20万人口的阿兹特克王国（墨西哥王国）。
随后又在与欧洲强国们海上争霸战中，以西班牙哈布斯堡王朝海军屡战屡胜，拥有了〈无敌舰队〉的华丽头衔，正是因为如此才敢凭借其超乎寻常的军事实力，扬言用2万多人吞并大明帝国。
不过他们这次打错了算盘，大明的综合国力和军队实力与战斗力，跟美洲阿兹特克王国（墨西哥王国）相比，根本不是一个数量级别的。
即使是到了现在的万历时期，其实力仍然足以碾压欧洲强国，因为早在西班牙哈布斯堡王朝之前，大明帝国已经和欧洲强国弗朗基王国（葡萄牙王国）、尼德兰王国（荷兰王国）多次交手，明军均全部取胜。
但此时的西班牙哈布斯堡王朝正处在严重的经济危机之中。
在此情况下，西班牙哈布斯堡王朝王室，要实现菲律宾总督所提出的征服大明帝国的计划，实际上已是力不从心了。
此外通过「古今形胜之图」和该图的西班牙说明，西班牙哈布斯堡王朝国王显然已经认识到像大明帝国，这样的强大国家是难以用武力来征服的。
但相反地，要是以西班牙哈布斯堡王朝的贵金属，来换取大明商品为主要内容的互补性贸易，显然对西班牙哈布斯堡王朝更加有利些。
所以西班牙哈布斯堡王朝国王就于明万历五年公元15年月29日，在致菲律宾总督的回信中，提出他的对大明帝国的战略构思称“西班牙语；你所议的征服大明之事，应当日后考虑，当前不可贸然行事，而应当与大明保持友好关系，尤其不能和那些与大明人敌对之海寇为伍，不能给大明人以任何仇视我们的口实。”
因此在明万历十四年公元1586年2月23日，菲律宾总督在收到西班牙哈布斯堡王朝国王的信时，才知道侵略大明之战就这样泡了汤。
随后中原河南承宣布政使司卫辉府淇县百姓：王安，造反联合湖广承宣布政使司黄州府蕲州乱民，形成「梅堂军」被官军大力围剿擒获，由黄州府黄梅县百姓：刘汝国，代替首领位置。
同时四川承宣布政使司境内明四川巡抚：徐元泰、明四川总兵：李应祥，分别集结了播州宣慰使司、酉阳宣慰使司、天全六番招讨使司、的驻军配合卫所军分数路进行镇压。
由明四川总兵充任中路指挥，在军中竖立红、白旗各一面，令陷入军中的无辜汉民徒手站立于红旗之下，又令不愿意依附叛军的苗、瑶居民徒手站立于白旗之下。
这样区别对待，使得多数人投降未参与到其中，免遭明军杀害，也就减少了反抗的力量。
2月25日明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，在对建州左卫女真苏克素浒河部、董鄂部，取得胜利之后，又剑指苏克素浒河部左邻哲陈部。
明建州左卫军民指挥使身先士卒，以佟·努尔哈赤，这个伪名字为由打着劫掠商人破坏边界安定之名出兵，以披甲兵二十五人、士卒五十人攻打建州左卫女真哲陈部界凡城，也是为了追捕之前的逃亡者。
但因对手准备充分，使得建州左卫军民指挥使司军队无所斩获，当回师到界凡城南部的太兰冈城时，界凡城主：讷申、萨尔浒城主：奈喀达（诺米纳之弟）、东佳城主：章佳·完济汉、巴尔达城主：沙达木，分别率领八百追兵赶来合围。
史称「玛尔墩城之战」建州左卫军民指挥使司方面才仅有四百人，由界凡城主：讷申、界凡主帅：巴穆尼，率先逼近建州左卫军民指挥使司军队。
明建州左卫军民指挥使则单骑回马迎敌，把界凡城主的马鞭给斩断，在回马挥刀砍中界凡城主后背将其劈为两段，又回身一箭击毙界凡主帅。
后方的追兵见主帅阵亡！均呆在一旁，其余三路不敢轻易靠近，明建州左卫军民指挥使为了安全亲自殿后，用疑兵之计与其部属亲信七人将身体隐蔽，貌似有伏兵一样仅露头盔，对方失去主帅军心不稳，又担心有伏兵因此不敢再追。
3月初3日，明神宗以天象异常下诏求言官上，希望廷臣们直言朝政，凡有妨害民生者，允许各衙门明白条具，奏请定夺，以仰回天意，以遂民生，共享天下太平之治。
于是明刑部员外郎：李懋桧、明户部云南清吏司郎中：刘复初，争相进言明郑皇贵妃及明王恭妃册封之事。
惹得明神宗勃然大怒，欲从重惩治，朝廷内外群臣们并没有因此而恐惧，还依旧上疏络绎不绝。