在无尽的岁月之中，人类对月球都有着各种猜想。有的观点认为月球是彗星撞击地球后地球上分离出的部分经过漫长岁月行程的。也有的观点认为月球实际上是外星人的飞船，是用来监视地球用的...
关于月球的假设和猜想层出不穷，然而在科学家提出猜想的数万年之后，月球毫无征兆的突然就脱离了地球，飞向无比神秘的外太空。
由于月球的突然离去，地月系统的突然失衡使地球面临全面性灾难：地球的潮汐系统失去了机能，海平面瞬间趋于太阳引力而造成多处地区出现了大洪水，这使地球上的陆地有将近百分之五十被海水吞没，接踵而来的便是因为全面的大饥荒使人类濒临灭绝。因自转轴倾角失衡，导致赤道和两极的其后反转，大量生物因此从地球上消失。地球上大部分的陆地消失，高山变成了岛屿，最大的亚洲大陆成为至今最大的一块大陆，与他比邻的欧洲大陆都已经全部淹没在海水中。因此世界变成了陆地之主和岛主的统治形态。
这个时代被称作黑暗纪元。
在这种危难之下，人类的数量急剧的减少，陆地上的生命也遭受到灭绝的灾难。人类的火种之所以能够延续下来，还必须归功于科学家已经将人类的dna进行保存，不仅如此，各种陆地生命的dna也被保存入。
幸存下来的人类转移到了地下世界，并在地下世界发展科学，并将科学运用到了地面上。于是一种能够发动制造潮汐的水能潮汐仪器被发明了出来，并大量投放进深海，这使海洋在没有月球的情况下也能恢复正常规律的潮汐运动。
然而科学家也在不断探索深海的时候，发现海洋怪物的存在。那些看似人类却有着和人类不同特征的海洋原住民被发现。他们有着凶残的本性，人类试图与他们建立联系却遭受到了攻击和入侵。比之更加可怕的还是深海中一些比海洋人类还要可怕的存在，他们被称作深海怪物。虽然他们使深海生物，也长时间生活在深海之中，但他们和海洋人类一样拥有在空气中不会爆裂而亡的高密度身体。海洋怪物的可怕就连海洋人类都会感到恐惧，更何况陆地上的人类。人类开始在陆地上尝试的结果受到来自深海两股势力的围攻。
然而在数百年之后，陆地上出现了新的主宰，精灵。精灵有着和人类一样的外表，但他们的耳朵明显比人类的更尖。精灵是最接近人类的种族，因此他们性情温驯，可以和人类长久共存，也成为人类可以信任的伙伴。人类和精灵开启了和深海怪物，深海人类的旷世之战，这一战争主要针对于海域的收复，这是为了防止在海洋上的人类活动遭受到深海邪恶力量的破坏，同时也是一种种族冲突。邪恶凶残的深海人类和深海怪物必须灭亡。
绿皮从精灵射手的描述中了解到了未来地球的情况。
在黑暗纪元之后的一千年，由于人类联合精灵对抗深海人类和深海怪物的战争趋于平衡，人类迎来了另一个崭新的时代，大航海时代。这个时代预示着人类科技的高度发展。一些科学家发明创造了可以改造岛屿的科技力量，将岛屿转化成一款游戏，可以通过升级经验来提升岛屿的繁荣程度。
岛屿游戏的最终目标便是创造出无比强大的岛屿军事基地。不论是对抗还是防御深海中的可怕存在，都起着至关重要的作用。