庾亮到寻阳后，宣太后诏，命温峤为骠骑将军、开府仪同三司，加郗鉴为司空。
温峤以苏峻未平而不接受，同时打算起兵讨伐苏峻，又分兵给庾亮。
庾亮和温峤本来互推为盟主而大家都推让不受，后因温充推荐征西大将军—陶侃而决定二人共推之，并派督护—王愆期到荆州通知陶侃。
起初，陶侃因为自己没有被任命为辅政大臣，所以愤怨而拒绝。
后来，虽然在温峤多番劝请下答应，并宣布苏峻和祖约的罪状以及派龚登领兵与温峤会合，但不久即追还龚登并反悔。
温峤唯有再度写信游说，并以其子—陶瞻之死刺激陶侃，最终才令陶侃感悟，自领兵温峤会合。
而徐州刺史—郗鉴所在的广陵，粮少城孤，又邻近北方外族政权，因此士民都无坚定守戍的意志。
但郗鉴收到升任司空的诏后即流涕誓师，要起兵讨伐苏峻，将士都争相要求参与。
陶侃到寻阳后，众人都称，陶侃要杀庾亮以谢天下。
庾亮感到害怕，于是，前去见陶侃并引咎自责。
最终，其表现令陶侃释怀，反更欣赏庾亮。
于是，讨伐军齐心要进攻建康，平灭苏峻，西军遂起兵。
同时，王导以太后密令要三吴吏士起义兵，以援救建康。
于是，会稽内史—王舒命早前逃亡到当地的庾冰行奋武将军，领兵一渡钱塘江；
吴兴太守—虞潭、吴国内史—蔡谟和前义兴太守—顾众都举兵向应。
至此，三吴的东军也起兵。
苏峻知道陶侃领导的西军起兵后，听从参军—贾宁的计谋，由姑孰退守石头城，分兵对抗西军各部。
而东军则派管商、张健和弘徽等拒战，与虞潭互有胜负，相持不下。
同时，苏峻又逼成帝迁到石头城。
之后，毛宝领兵袭击迎纳苏峻米粮的祖约司马—桓抚，夺取全部米粮，令祖约更加缺粮。
随后，郗鉴率众渡江，与陶侃在茄子浦会合，并与陶侃以水军直指石头城。
当时，苏峻见在查浦的陶侃军和沙门浦的温峤军兵士众多，显得畏惧。
但另一方面，在广德的桓彝显得孤立无援，周边郡县都向苏峻投降。
但桓彝坚决不降，后被韩晃击败并围困，最终城陷被俘杀。
东军方面，苏峻曾经赦免庾亮诸弟以取悦众心，但仍派张健、管商、弘徽等人进攻。
起初虽有小胜，但后来庾冰与顾飏皆被张健击败，使得吴郡郡城被张健所掠。
后来，顾众与虞潭也被管商击败，分守吴兴及柴辟。
之后，虞潭再于吴兴战败，吴兴郡的东迁、余杭和武康都因其军败退而被苏峻军抢掠。
虞潭派往吴县的督护—沈伊也败于管商，这使得抵抗形势很不明朗。
而一众西路讨伐军逼近石头城时就打算作一次决定性战役，但陶侃认为苏峻兵强难以争锋，打算行持久战并以智谋击败他。
后因多次交战都无大成果，更筑白石垒固守，由庾亮领二千守军据守。
不久，苏峻以万人来攻，但都不能攻破。
于是，陶侃命郗鉴和郭默还驻京口，建大业、曲阿和庱亭三垒分散苏峻军力。
祖约则派遗祖涣和桓抚攻打在马头山的桓宣，毛宝领兵救援并成功击败对手，令桓宣解困并投归温峤。
之后，毛宝又于东关与祖约作战，攻破合肥戍。
此时，祖约诸将暗中勾结后赵，作为内应。
于是，后赵派石聪和石堪渡过淮河进攻祖约驻守的寿春。
祖约被后赵军击败，逃奔历阳，而赵军则虏胁寿春二万多户人北归。
苏峻心腹—路永、匡术和贾宁知道祖约兵败后都感到害怕，于是劝苏峻尽诛大臣，改立腹心。
但苏峻敬重王导，不肯接受。
路永等因而对苏峻离心，反令王导有机可乘，派参军—袁耽诱使路永归顺。
之后，王导试图救出成帝投奔义军，但因守备森严而失败。
于是，王导带二子与路永逃到白石。
讨伐军与苏峻军相持不下，而苏峻分遣诸将四出攻掠，令群情恐惧。